CIAinVET - Animais produtores de alimentos como reservatórios de resistência a antibióticos de importância critica

Objetivos:

• Investigar a colonização intestinal de bovinos, suínos e aves por estirpes de Escherichia coli e Salmonella spp. resistentes aos antibióticos de importância crítica (CIA) através da caracterização dos respetivos perfis de suscetibilidade aos antibióticos;
• Caracterizar os mecanismos de resistência e o seu enquadramento no contexto genético;
• Identificar a diversidade de elementos genéticos móveis envolvidos na disseminação dos determinantes de resistência aos antibióticos detetados;
• Revelar a ligação genética entre os determinantes de resistência aos antibióticos e os determinantes da virulência, avaliando assim o impacto que a pressão seletiva exercida pelos antibióticos pode exercer sobre a virulência bacteriana;
• Promover e alargar a consciencialização de todos os intervenientes no processo (produtores, veterinários, inspetores, consumidores) sobre a disseminação da resistência aos antibióticos através da cadeia alimentar.

Atividades:

• Gestão e coordenação do projeto.
• Isolamento e caracterização de isolados resistentes a antibióticos de importância crítica.
• Caracterização genómica de isolados resistentes aos antibióticos de importância crítica por Sequenciação Completa do Genoma (WGS).
• Caracterização dos perfis do resistoma, mobiloma e viruloma de isolados resistentes aos antibióticos de importância crítica.
• Caracterização molecular específica da resistência.
• Ligação genética e mobilização dos genes de virulência e de resistência a antibióticos em genomas bacterianos.
• Consciencialização pública sobre a emergência da resistência antimicrobiana.

Resultados esperados:

• Identificação das principais famílias de genes de resistência aos antibióticos presentes em amostras biológicas de animais da cadeia alimentar em Portugal.
• Reconhecimento do potencial epidémico dos principais genes de resistência aos antibióticos na produção animal, pela caracterização dos elementos genéticos móveis mecanismos de transferência horizontal de genes envolvidos.
• Compreensão do papel que a exposição a antibióticos exerce na seleção de bactérias patogénicas.
• Estabelecimento de algoritmos que permitam uma rápida análise in silico de conjuntos de dados, tendo como objetivo último a deteção precoce de novos genes e variantes de resistência emergentes.
• Agregação de dados epidemiológicos relevantes para complementar e melhorar a vigilância da resistência aos antibióticos.
• Melhoria da previsão da emergência e disseminação de clones bacterianos resistentes relevantes para implementação de estratégias de avaliação e gestão de risco, evitando a disseminação de bactérias multirresistentes e preservando a eficácia dos antibióticos de importância critica.

Site: https://projects.iniav.pt/ciainvet
E-mail: ciainvet@iniav.pt