COLOSSUS - Control Of tubercuLOsiS at the wildlife/livestock interface uSing natUre-based Solutions

Os objetivos específicos deste projeto são:

• inferir as cadeias de transmissão direta e indireta de M. bovis em ungulados domésticos e selvagens com base em filodinâmica e metadados;
• reconstruir a história epidemiológica e demográfica de M. bovis nas regiões onde a TB é endémica, explorando a informação natural presente no genoma do agente patogénico;
• hierarquizar o risco de infeção em diferentes áreas espaciais, diferentes hospedeiros e cenários epidemiológicos distintos;
• identificar a(s) espécie(s) chave na(s) qual(is) devem ser priorizadas intervenções em áreas territoriais selecionadas;
• avaliar o efeito de adicionalidade do ambiente contaminado com M. bovis na transmissão;
• desenvolver uma aplicação computacional, assente nos modelos eco-epidemiológicos estabelecidos, que quantifique a relação custo/eficácia de diferentes opções de intervenção em variados cenários epidemiológicos.

Atividades:

• Sequenciação completa do genoma de centenas de isolados clínicos de M. bovis obtidos de bovinos, javalis e veados em diferentes contextos espaciotemporais e cenários epidemiológicos.
• Desenvolvimento de um método baseado em Two-Pass CARD-FISH e citometria de fluxo que caraterize a viabilidade, resiliência e o genoma de M. bovis presente no ambiente, avaliando-se quantitativamente o peso desta componente nas cadeias de transmissão indireta;
• Avaliação do impacto de fatores bióticos e abióticos na transmissão e disseminação geográfica de M. bovis, através de técnicas de modelação ecológica.
• Avaliação da influência do movimento, área vital e demografia dos hospedeiros na biogeografia e transmissão de M. bovis, através de técnicas de modelação ecológica.
• Desenvolvimento de uma metodologia quantitativa, baseada em múltiplas escalas (bottom-up), para incorporar metadados e filodinâmica em modelos matemáticos de transmissão.
• Simulações estocásticas assentes na manipulação formal de variáveis explicativas dos modelos eco-epidemiológicos preditivos desenvolvidos para inferir o impacto de diferentes opções de intervenção.
• Promoção de atividades de disseminação e transferência de conhecimento, através da divulgação junto de pares dos resultados do projeto (ex. reuniões técnicas, artigos científicos, apresentações em congressos, etc.) e, por outro lado, comunicar e envolver os stakeholders e o público em geral nas problemáticas do projeto (ex. livro de boas práticas, vídeos tutoriais, formação em zonas de caça e em explorações de bovinos, artigos de divulgação científica, atividades de educação ambiental, vídeos de divulgação com as principais conclusões do projeto, criação de uma webpage do projeto, etc.).

Resultados esperados:

No final do projeto, espera-se desenvolver uma aplicação computacional inovadora capaz de simular e quantificar a eficácia e a relação custo/benefício de intervenções várias (vacinação, remoção seletiva ou aleatória, biossegurança, descontaminação ambiental) no controlo da tuberculose animal em diferentes ecossistemas e cenários epidemiológicos.

A transferência de conhecimento e comunicação dos resultados acumulados aos stakeholders permitirá informar e apoiar a decisão de autoridades oficiais, proprietários, entidades gestoras e caçadores, sobre as melhores opções de prevenção e controlo de TB, tendo por base uma rede estruturada de dados quantitativos.