Laboratório de FITOBACTERIOLOGIA
QUEM SOMOS
O Laboratório de Fitobacteriologia é parte integrante do Laboratório Nacional de Referência para a Sanidade Vegetal. Desenvolve investigação aplicada em bactérias fitopatogénicas, de quarentena e reguladas, com impacto nas fileiras agrícolas a nível nacional e Europeu. Apoia a Autoridade Fitossanitária Nacional na definição de planos de controlo, procedimentos de amostragem e diagnóstico e dá apoio Técnico e Científico aos Laboratórios Oficiais Nacionais e Regionais. Realiza a disseminação de conhecimento especializado através da formação técnica e científica às diversas fileiras e inspetores fitossanitários. Não menos relevante, presta apoio especializado à Comunidade através da clínica fitossanitária em plantas hortícolas, fruteiras e florestais, solo, sementes e águas superficiais de rega.
Possui uma equipa composta por recursos humanos com formação altamente especializada e competências específicas. Encontra-se equipado para a implementação de métodos de diagnóstico clássicos, serológicos e biomoleculares e de câmaras de confinamento biológico destinadas a estudos epidemiológicos com organismos de quarentena. Detém ainda uma vasta Coleção de trabalho de estirpes bacterianas portuguesas e internacionais criopreservadas utilizadas em estudos de biodiversidade, virulência e adaptação ecológica.
MISSÃO
- Atividades de Investigação e apoio a projetos, em articulação com outros laboratórios (e.g. Entomologia, Micologia, Microbiologia do Solo, Virologia, etc.) e instituições de I&D;
- Execução das análises dos Planos Nacionais de Controlo de Organismos de Quarentena e dos Organismos da Qualidade (para a certificação de material vegetal e de viveiros);
- Realização de análises para a deteção e identificação de bactérias fitopatogénicas em diferentes matrizes (plantas, madeira, insetos, solo, sementes, etc.);
- Apoio a entidades públicas ou privadas do sector agrícola e florestal;
- Avaliação do risco de perturbação dos ecossistemas agrícolas e florestais decorrente da introdução de potenciais bactérias fitopatogénicas.
VISÃO
Apoio à implementação da estratégia do INIAV, I.P. enquanto Laboratório de Estado e de Laboratório Nacional de Referência para a Sanidade Vegetal.
OBJETIVOS
Diagnosticar e estudar bactérias fitopatogénicas de quarentena, regulamentadas ou outras que afetam plantas cultivadas, incluindo espécies fruteiras e florestais, hortícolas e ornamentais;
Aprofundar o conhecimento das suas interações com os seus hospedeiros e outros organismos (insetos, fungos, vírus, etc.), visando mitigar os danos causados;
Divulgar e promover o conhecimento técnico e científico no domínio da Fitobacteriologia.
ÁREAS DE INTERVENÇÃO
INVESTIGAÇÃO
Participação em projetos de investigação e implementação de linhas de ação que visem a proteção e gestão agro-florestal; atividades desenvolvidas em articulação com outros laboratórios do INIAV e Instituições de I&D..
PRESTAÇÃO DE SERVIÇOS
Diagnóstico e clínica fitossanitária através de análises em diversas matrizes (madeira, insetos, partes de plantas, solos, etc.).
FORMAÇÃO
Promoção e participação em ações de formação destinadas a diversos públicos-alvo (ensino básico; profissional; universitário e pós graduações). Orientação e acompanhamento de mestrandos e doutorandos de diferentes nacionalidades e formação especializada.
Sintomas da doença do pus causados por Ralstonia solanacearum, em batateira
Sintomas da doença de tumor bacteriano causados por Agrobacterium tumefaciens, em plantas lenhosas
Sintomas da doençade mancha bacteriana causados por Pseudomonas coriandricola, em coentros
Sintomas da doença do cancro bacteriano causados por Pseudomonas syringae pv. actinidiae, em flores de kiwi
Sintomas da doença do fogo bacteriano causados por Erwinia amylovora, em macieira
Sintomas da doença do cancro bacteriano causado pelo complexo de espécies de Pseudomonas syringae, em cerejeira.
Sintomas da doença do mal murcho causados por Ralstonia solanacearum, em tomateiro
Sintomas da doença do cancro bacteriano causado por Xylophilus ampelinus, em folhas de videira
Divulgação
BOLETINS
MANUAL TÉCNICO
Duarte, Lídia; Fernandes, Camila; Cruz, Joana; Velez, Isaura; Cruz, Leonor. Boas práticas na cultura da batata-doce: doenças provocadas por bactérias (2020)
Fernandes, Camila; Duarte, Lídia; Cruz, Leonor. Boletim Técnico SAFSV-BT- 02/2019: Cancro bacteriano das prunóideas (2019)
Cruz, Leonor; Cruz, Joana; Duarte, Lídia. Controlo de doenças causadas por bactérias. Batata-Doce. Manual de boas práticas agrícolas Capítulo 2 (2021): 101-109
ARTIGOS EM REVISTA
- Fernandes, Camila; Martins, Leonor; Sousa, Rui; Cruz, Leonor; Tavares, Fernando. "Bacteriose da nogueira: epidemiologia de um relevante problema fitossanitário em Portugal", VIDA RURAL - Revista Profissional de Agronegócios, (2020).
- Cruz, Leonor; Fernandes, Camila; Duarte, Lídia; Velez, Isaura; Lopes, Amélia. "Bacterioses da floresta: a doença do choro dos choupais causada por Lonsdalea populia", VIDA RURAL - Revista Profissional de Agronegócios, (2020).
- Fernandes, Camila; Duarte, Lídia; Velez, Isaura; Cruz, Leonor. "Cancro bacteriano das prunóideas: novos surtos em Portugal", VIDA RURAL - Revista Profissonal de Agronegócios, (2020).
- Cruz, Leonor; Fernandes, Camila; Duarte, Lídia; Velez, Isaura. "Bacteriose dos frutos secos: riscos, epidemiologia e controlo de doenças com potencial impacto económico", VIDA RURAL - Revista Profissional de Agronegócios, (2019).
- Cruz, Leonor. EPPO and Euphresco: how to ensure high quality, harmonised plant health diagnostics in the EPPO region. EUROPEAN UNION & INTERNATIONAL STANDARDS. Euroreference 3, (2017).
ARTIGOS COM ARBITRAGEM CIENTÍFICA
- Nones, Stefano; Fernandes, Camila; Duarte, Lídia; Cruz, Leonor; Sousa, Edmundo. Bacterial community associated with the ambrosia beetle Platypus cylindrus on declining Quercus suber trees in the Alentejo region of Portugal. Plant Pathology (2022).
- Fernandes, Camila; Duarte, Lídia; Naves, Pedro; Sousa, Edmundo; Cruz, Leonor. First report of Brenneria goodwinii causing acute oak decline on Quercus suber in Portugal (2022). DOI : 10.1007/s42161-022-01046-w.
- Fernandes, Camila; Martins, Leonor; Teixeira, Miguel; Blom, Jochen; Pothier, Joël F; Fonseca, Nuno A.; Tavares, Fernando. Comparative Genomics of Xanthomonas euroxanthea and Xanthomonas arboricola pv. juglandis Strains Isolated from a Single Walnut Host Tree. Microorganisms 9, 3 (2021): 624.
- Teixeira, Miguel; Fernandes, Camila; Chaves, Cátia; Pinto, Joana; Tavares, Fernando; Fonseca, Nuno A. Complete Genome Sequence Obtained by Nanopore and Illumina Hybrid Assembly of Xanthomonas arboricola pv. juglandis CPBF 427, Isolated from Buds of a Walnut Tree. Microbiology Resource Announcements 10, 10 (2021): 00085-21.
- Fernandes, Camila; Albuquerque, Pedro; Mariz-Ponte, Nuno; Cruz, Leonor; Tavares, Fernando. "Comprehensive diversity assessment of walnut-associated xanthomonads reveal the occurrence of distinct Xanthomonas arboricola lineages and of a new species (Xanthomonas euroxanthea ) within the same tree". Plant Pathology 70,4 (2021): 943-958.
- Cellier, Gilles; Redondo, Cristina; Cubero, Jaime; Rosselló, Montserrat; Andrade, Eugénia; Cruz, Leonor; et al. “Comparison of the performance of the main real-time and conventional PCR detection tests for ‘Candidatus Liberibacter’ spp., plant pathogenic bacteria causing the Huanglongbing disease in Citrus spp. European Journal of Plant Pathology 157 (2020):919-941.
- Martins, Leonor; Fernandes, Camila; Blom, Jochen; Dia, Nay C.; Pothier, Joël F.; Tavares, Fernando. "Xanthomonas euroxanthea sp. nov., a new xanthomonad species including pathogenic and non-pathogenic strains of walnut". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 12 (2020): 6024-6031.
- Teixeira, Miguel; Martins, Leonor; Fernandes, Camila; Chaves, Cátia; Pinto, Joana; Tavares, Fernando; Fonseca, Nuno A.. "Complete Genome Sequences of Walnut-Associated Xanthomonas euroxanthea Strains CPBF 367 and CPBF 426 Obtained by Illumina/Nanopore Hybrid Assembly". Microbiology Resource Announcements 9, 45 (2020): e00902-20.
- Martins, Leonor; Fernandes, Camila; Blom, Jochen; Dia, Nay C.; Pothier, Joël F.; Tavares, Fernando. "Xanthomonas euroxanthea sp. nov., a new xanthomonad species including pathogenic and non-pathogenic strains of walnut". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70,12 (2020): 6024-6031.
- Martins, Leonor; Fernandes, Camila; Albuquerque, Pedro; Tavares, Fernando. "Assessment of Xanthomonas arboricola pv. juglandis Bacterial Load in Infected Walnut Fruits by Quantitative PCR". Plant Disease 103, 10 (2019): 2577-2586.
- Giovani, B.; Anthoine, G.; Blümel, S.; Cruz, M. L.; Peña, A. I.; Maes, M.; Phillipson, B.; Schenk, M.; Steinmöller, S.. "Transnational European research collaboration to tackle plant health threats: Euphresco and its contribution to the new EU Plant Health Regulation". EPPO Bulletin 49, 1 (2019): 87-91.
- Fernandes, Camila; Blom, Jochen; Pothier, Joël F.; Tavares, Fernando. "High-Quality Draft Genome Sequence of Xanthomonas arboricola pv. juglandis CPBF 1521, Isolated from Leaves of a Symptomatic Walnut Tree in Portugal without a Past of Phytosanitary Treatment". Microbiology Resource Announcements 7, 16 (2018): 1-3.
- Fernandes, Camila; Blom, Jochen; Pothier, Joël F.; Tavares, Fernando. "High-Quality Draft Genome Sequence of Xanthomonas sp. Strain CPBF 424, a Walnut-Pathogenic Strain with Atypical Features". Microbiology Resource Announcements 7, 15 (2018): 1-3.
- Fernandes, Camila.; Sousa, Rui.; Tavares, Fernando.; Cruz, Leonor. "First Report of Xanthomonas arboricola Causing Bacterial Blight on Pecan Trees in Portugal". Plant Disease 102, 12 (2018): 2632.
- Loreti, Stefania; Cunty, Amandine; Pucci, Nicoletta; Chabirand, Aude; Stefani, Emilio; Abelleira, Adela; Balestra, Giorgio M; Cruz, Leonor; et al. "Performance of diagnostic tests for the detection and identification of Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa) from woody samples". European Journal of Plant Pathology 152, 3 (2018): 657-676.
- Cruz, Leonor; Cruz, Joana; Sousa, Rui. “Studies on differential susceptibility of ‘Rocha’ pear clones and Portuguese varieties of pear and apple to fire blight – tools for the sustainability of fruit chain production”. SCAP, Revista de ciências Agrárias 41 (2018): 92-96.
ARTIGOS EM ACTAS
- Cruz, Leonor; Fernandes, Camila; Duarte, Lídia. "Bacterioses dos frutos secos: riscos, epidemiologia e controlo de doenças com potencial impacto económico em pomares portugueses". 4º Simpósio Nacional de Fruticultura. Actas Portuguesas de Horticultura 32 (2018): 15-23.
- Nones, Stefano., Cruz, Leonor., Fernandes, Camila., Duarte, Lídia., Sousa, Edmundo. “New insights into the bacterial diversity associated with symptomatic Quercus suber trees infested by the ambrosia beetle Platypus cylindrus (Coleoptera: Curculionidae). IOBC Wprs Bull 152 (2020): 51-54.
Equipa e Contactos
Equipa
- Maria Leonor Pato da Cruz (Responsável técnica)
- Camila Borges Fernandes
- Lídia Alcobia Martins Duarte
- Daniel Ribeiro da Silva McGuire
- Imaculada Medina Wahnon Pinto
Contactos
Unidade Estratégica Investigação e Serviços de Sistemas Agrários e Florestais e Sanidade Vegetal (UEIS-SAFSV)
Av. da República, Quinta do Marquês - Edifício Florestal
2780-157 Oeiras – Portugal
E-mail: consultas.safsv@iniav.pt
