Discover – Discovering the sources of Salmonella, Campylobacter, VTEC and antimicrobial Resistance

Objetivo principal:

O foco principal deste projeto será enfrentar os desafios da atribuição de causas nos três principais agentes bacterianos zoonóticos transmitidos via cadeia alimentar: Salmonella spp., Campylobacter jejuni/coli, e Escherichia coli produtora de shiga toxina/vero toxina (STEC/VTEC), incluindo os seus perfis de antibioresistência, de um modo interdisciplinar, através de uma abordagem abrangente e aplicando várias metodologias e modelos diferentes de modo comparativo, no conceito One Health.

Objetivos:

• Preencher as lacunas atuais de conhecimento em relação a potenciais causas de zoonoses transmitidas por alimentos, incluindo dados sobre reservatórios não animais e causas não alimentares, fornecendo assim estimativas de atribuição de causas em diferentes pontos da cadeia de exposição nos vários países da UE.
• Avaliar criticamente e melhorar os modelos de atribuição de causas existentes, incluindo abordagens baseadas em subtipagem microbiana, estudos de controle de casos, investigação em surtos e avaliação de exposição.
• Quantificar as contribuições dos vários reservatórios animais, incluindo animais selvagens e de companhia, causas alimentares e ambientais, e vias de transmissão, considerando as diferenças geográficas em toda a Europa e os parceiros do consórcio.
• Utilização de técnicas de tipagem fenotípica e genómica, para a caracterização da resistência dos vários agentes zoonóticos aos antimicrobianos, bem como dados epidemiológicos, para atribuição de causa.
• Melhorar os modelos de atribuição de causas existentes e desenvolver novos que sejam responsáveis pela multidirecionalidade da transmissão, incluindo a transmissão entre reservatórios e a população humana.
• Fornecer recomendações sobre a transferência de resultados obtidos a partir dos modelos de atribuição de causa, para ações de prevenção e controle.

Atividades:

• Identificação e recolha de dados entre os vários parceiros do projeto, considerando os requisitos estabelecidos. O trabalho será iniciado através do mapeamento dos dados existentes e estabelecimento de uma plataforma conjunta de compartilhamento de dados. Os dados serão organizados de acordo com o agente patogénico e o tipo de abordagem de atribuição de causa, região geográfica/país.
• Recolha de amostras provenientes de animais selvagens e de companhia durante o ano de 2020, para isolamento de Salmonella, Campylobacter, VTEC e suscetibilidade antimicrobiana das estirpes isoladas e identificadas.

Resultados esperados:

• Abordagem metodológica de atribuição de causas dentro do conceito One-Health para vigilância e controlo de Salmonella, Campylobacter, VTEC e resistência antimicrobiana: opções, necessidades, prioritização.
• Resultados de atribuição de causas obtidos para os vários agentes zoonóticos serão apresentados regionalmente / país, para cada um dos métodos aplicados.